基建专项债券的会计处理需区分不同主体和业务场景。地方政府专项债券作为政府主导的融资工具，其资金拨付、使用及项目运营涉及行政事业单位、代建单位和国有企业等多方主体，会计处理需遵循专款专用原则，并严格区分财务会计与预算会计的双重核算体系。核心流程包括资金接收、项目建设、资产形成及收益分配等环节，不同模式下会计分录呈现差异化特征。
一、专项债券资金接收的会计处理
行政事业单位从财政部门取得专项债券资金时，需进行双重核算。财务会计层面：借：银行存款/零余额账户用款额度
贷：财政拨款收入
预算会计层面同步记录：
借：资金结存—货币资金
贷：财政拨款预算收入。若需单独反映专项债券资金来源，应在“财政拨款收入”科目下设地方政府专项债券资金收入明细科目。对于国有企业作为资金承接方的情况，收到债券资金时则贷记专项应付款科目。
二、项目建设阶段的差异化处理
项目建设模式分为自行建设和代建模式两类：
- 自行建设时，支付工程款形成资产：
财务会计：
借：在建工程—建筑安装工程投资/设备投资
贷：银行存款
预算会计：
借：行政支出/事业支出—资本性支出
贷：资金结存—货币资金。 - 代建模式下，代建单位需设置代建项目科目：
- 拨付代建工程款时：
借：预付账款—预付工程款
贷：银行存款 - 按进度确认成本时：
借：在建工程—建筑安装工程投资
贷：预付账款—预付工程款。代建单位（事业单位）还需通过代建项目转出科目进行工程成本结转，并冲减预收账款。
- 拨付代建工程款时：
三、项目收入与资产权属的核算要求
专项债券项目产生的专项收入需严格管理。国有企业代收项目收益时，通过其他应付款科目核算代收款项，上缴财政时冲减该科目。对于形成的资产，若无偿划转国有企业，需将专项应付款转为资本公积，同时将资产确认为自有资产；若移交主管部门，则直接冲减资产账面价值。需注意的是，项目资产不得用于融资担保，确保专项债券偿债来源安全。
四、利息计提与债券偿还的特殊处理
专项债券利息需根据实际利率法进行分摊。发行方（政府）计提利息时，利息调整通过应付债券—利息调整科目处理；使用单位若涉及利息支出，需区分资本化与费用化处理，例如计入在建工程或财务费用。债券到期偿还时，国有企业需根据财政安排，通过专项应付款或资本公积进行债务核销，避免混淆企业自有负债与政府债务。
五、实务操作中的风险控制要点
会计处理需关注债务主体界定与建设模式匹配性。若项目采用特许经营或资本金注入模式，需明确资产权属与收益分配机制，避免因权责不清导致会计错配。此外，专项债券资金应严格用于形成实物工作量，支付工程款时需同步确认在建工程成本，确保资金流向与预算申报一致性。对于跨年度项目，需建立备查簿跟踪资金使用进度及资产转固时点。
