互助基金的会计处理需基于借贷平衡原则，通过资产类、负债类、净资产类、收入类及费用类科目记录资金流动。其核心在于准确反映资金流向与科目间的关联性，例如收到财政拨款需同时体现银行存款增加与收入来源，而逾期借款核销则涉及费用确认与资产减值。以下从收入、支出、资产与负债管理、年末结转四个维度展开说明。
收入类分录需按来源性质区分核算。当收到政府补助收入时，若为项目专项资金或风险防范资金，应记为限定性收入。例如互助组织收到财政拨入互助金补助时：
借：银行存款
贷：政府补助收入—互助金补助。
捐赠收入需根据用途分类，互助金捐赠计入限定性净资产，其他捐赠则转入非限定性净资产。会费收入在社员缴纳时直接贷记，年末转入限定性净资产—社员资本。此外，资金占用费收入需按章程分配公益金、公积金及风险准备金，部分转入限定性净资产。
支出类分录包含日常运营与特殊费用。业务活动成本主要用于核销无法收回的借款，例如逾期借款确认坏账时：
借：业务活动成本—坏账损失
贷：应收账款—逾期借款。
提取互助金损失准备需按年末投放金余额的1%计提，例如2016年初计提2.8万元：
借：管理费用
贷：互助金损失准备。
管理人员的补助发放则直接计入现金流出：
借：业务活动成本
贷：现金。
资产与负债管理需关注资金形态转换及风险控制。现金与银行存款的划转分录为：
借：银行存款
贷：现金（存入时），
反之提取现金则借贷方向相反。对于逾期借款，需从正常借款科目转入逾期科目：
借：应收账款—逾期借款
贷：应收账款—正常借款。
收回已核销的呆账需同步恢复准备金：
借：资金投放金
贷：互助金损失准备。
年末结转需将收入与费用科目余额转入净资产。限定性净资产接收政府补助、捐赠及会费收入的指定用途部分，例如：
借：政府补助收入—互助金补助
贷：限定性净资产—集体资本。
非限定性净资产则归集其他补助、利息收入等非专项资金。费用类科目如业务活动成本需转入限定性净资产冲减：
借：限定性净资产
贷：业务活动成本。
此过程需严格遵循章程规定，优先用风险准备金冲抵坏账，不足时依次动用公积金、集体资本。
