当上市公司以低于股票面值或账面价值的价格进行股份回购时，其会计处理需要遵循特殊的记账规则。这种情况通常发生在公司实施股权激励计划后，因员工未达成考核目标而需强制回购限制性股票，或是出于优化资本结构目的进行的折价回购。不同于溢价回购的会计处理，折价回购会产生资本公积增加的财务效果，这对企业所有者权益结构将产生直接影响。
在折价回购的初始阶段，企业需要按实际支付对价确认库存股。假设某公司以每股8元回购面值10元的股票1万股，支付手续费500元，则记账公式为：借：库存股 80,500元
贷：银行存款 80,500元
这里需要特别注意的是，手续费需计入库存股成本，这与常规金融资产交易中手续费计入当期费用的处理方式存在本质差异。这种处理方式源于《企业会计准则第37号》将库存股界定为所有者权益的抵减项，而非金融资产。
当完成股票注销时，会计处理的核心在于处理回购价格与面值的差额。以前述案例为例，股票面值总额为10万元（1万股×10元），实际回购成本80,500元，差额19,500元应计入资本公积：借：股本 100,000元
贷：库存股 80,500元
贷：资本公积——股本溢价 19,500元
这种处理逻辑体现了权益工具交易的实质：折价回购相当于公司以低于注册资本的价格收回股权，形成的差额实质上是股东对公司资本的追加投入。实务中若存在库存股分批回购的情况，需按加权平均法计算每股回购成本。
当企业存在资本公积不足的特殊情形时，折价回购可能引发更复杂的会计调整。例如某公司回购5,000股面值2元的股票，支付总额8,000元（含手续费），若此时资本公积科目余额仅3,000元，则差额处理需遵循特定顺序：
- 冲减既有资本公积——股本溢价3,000元
- 剩余不足部分1,000元（5,000×2元面值 - 8,000元回购价 - 3,000元资本公积）转入利润分配——未分配利润
这种分层处理机制确保了会计信息如实反映经济实质，避免人为操纵所有者权益结构。
折价回购的后续影响主要体现在每股收益提升和资本结构优化两方面。通过减少在外流通股数量，企业的每股收益（EPS）将获得机械性提升，这对市值管理具有积极作用。但同时需注意，若频繁进行折价回购可能引发监管关注，特别是当回购价格显著低于公允价值时，可能涉及利益输送的合规风险。根据《上市公司股份回购规则》，此类交易需严格履行信息披露义务，并在财务报表附注中披露回购定价依据和公允价值评估方法。
