农村饮水安全项目的资金核算需遵循专款专用原则，根据工程性质与资金属性进行差异化处理。中央预算内固定资产投资补助资金形成的资产需区分产权归属，其会计处理直接影响资产负债表与成本核算的准确性。项目从建设到竣工的全周期中，待核销基建支出、交付使用资产等科目贯穿始终，而质量保证金制度与财务决算程序则是确保资金合规性的关键环节。
对于户用饮水工程（单户或联户），中央补助资金形成的资产产权归属农户时，建设单位需通过待核销基建支出科目核算。具体流程为：
- 收到中央补助资金时：借：银行存款
贷：专项应付款——农村饮水安全项目 - 支付工程款时：
借：在建工程——户用饮水工程
贷：银行存款 - 竣工决算后冲销资金：
借：待核销基建支出
贷：在建工程——户用饮水工程
同时需在竣工财务决算中明确资产归属，该科目最终不纳入建设单位资产总额。
若工程产权归本单位或农村集体组织，中央补助资金需计入交付使用资产。操作步骤如下：
- 建设期间支付工程款：
借：在建工程——集体饮水工程
贷：银行存款 - 竣工验收后结转资产：
借：固定资产——饮水设施
贷：在建工程——集体饮水工程
借：专项应付款——农村饮水安全项目
贷：资本公积/递延收益
对于产权移交其他单位的情况，则通过转出投资科目处理，并在决算后冲减对应资金。
工程价款结算需预留5%质量保证金，账务处理需分阶段完成：
- 支付工程进度款时：
借：应付账款——施工单位
贷：银行存款
其他应付款——质量保证金（结算金额的5%） - 质保期满后支付保证金：
借：其他应付款——质量保证金
贷：银行存款
该机制既保障工程质量，又通过负债科目实现资金风险管控。
政府补助资金的核算需区分用途。直接补助经营性项目的资金计入其他收益，例如：借：银行存款
贷：其他收益——政府补助
而与资产相关的补助（如冷库建设）则通过递延收益分期确认：
- 收到补助时：
借：银行存款
贷：递延收益 - 资产折旧期间分摊：
借：递延收益
贷：其他收益
这种处理方式实现收益与成本配比，避免利润表波动。
项目竣工后需在3个月内完成财务决算，逾期未办理视同完工并停止资金支付。决算编制需包含：
- 工程实际成本与预算对比分析
- 待核销基建支出明细
- 质量保证金计提凭证
- 产权转移法律文件
通过专项应付款科目清理，确保资金闭环管理。未按规定执行的单位将面临资金追缴及行政处罚。
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