初级农产品会计处理涉及从采购到销售的完整链条，其核心在于准确核算进项税额抵扣、成本归集和税务处理。对于一般纳税人而言，收购环节的增值税抵扣直接影响后续成本核算，而小规模纳税人则需要全额计入采购成本。通过规范化的会计分录体系，既能满足会计准则要求，又能有效控制税务风险。
在农产品收购环节，一般纳税人需区分价税分离处理。假设收购价款80,000元，按9%计算可抵扣进项税额7,200元，实际采购成本72,800元。此时会计分录为：
借：原材料——初级农产品 72,800
借：应交税费——应交增值税（进项税额）7,200
贷：银行存款/应付账款 80,000
小规模纳税人因无抵扣权限，需将全部价款计入存货成本。若存在入库前合理损耗（如运输损耗），直接按发票金额通过在途物资科目核算，损耗价值最终转入存货成本。
加工环节的账务处理需遵循成本归集原则。领用72,800元初级农产品时，需将人工费15,000元和制造费用10,000元同步归集：
借：生产成本——加工产品 97,800
贷：原材料——初级农产品 72,800
贷：应付职工薪酬 15,000
贷：制造费用 10,000
完工入库时结转库存商品：
借：库存商品——加工后产品 97,800
贷：生产成本——加工产品 97,800
销售环节需重点关注增值税税率适用。若加工后产品售价120,000元，一般纳税人按13%税率确认销项税额15,600元：
借：应收账款/银行存款 135,600
贷：主营业务收入 120,000
贷：应交税费——应交增值税（销项税额）15,600
成本结转对应库存商品账面价值：
借：主营业务成本 97,800
贷：库存商品——加工后产品 97,800
特殊场景处理需注意三点：
- 合理损耗应计入采购成本，不单独核销
- 小规模纳税人销售时按简易征收率计算增值税，无进项抵扣
- 期末结转需将主营业务成本转入本年利润：
借：本年利润
贷：主营业务成本
该处理体系要求会计人员精准把握进项税额抵扣率变动、成本分摊方法和税务政策更新。建议建立明细科目追踪不同批次农产品成本，定期进行存货盘点确保账实相符。对于农业企业特有的生物资产转换（如幼苗培育），需按消耗性生物资产科目单独核算。
