在企业日常运营中，药品调拨涉及库存管理和会计核算的双重规范要求。调拨行为可能发生在集团内部关联公司、总分公司之间，或同一公司不同仓库/部门之间，其会计处理需根据调拨性质选择科目。药品作为特殊存货，其调拨需兼顾药品流通特性与会计准则要求，既要反映资产权属变动，又要符合税务处理规范。
对于总分公司之间的药品调拨，总公司的会计处理需体现资产控制权转移。若调拨药品属于无偿划转，总公司应借记"拨付所属资金"科目，贷记"库存商品"或"库存药品"科目。例如调拨价值50万元药品时，分录为：
借：拨付所属资金--流动资金 500,000
贷：库存商品--药品 500,000
分公司则需反向记录资产接收：
借：库存商品--药品 500,000
贷：上级拨入资金--流动资金 500,000
公司内部调拨若未改变药品所有权，仅涉及存放地点变更，应采用库存科目对冲方式。如将A仓库药品调至B仓库，分录为：
借：库存商品--B仓库
贷：库存商品--A仓库
此时需同步更新药品的批次管理台账和仓库明细账，确保账实相符。若调拨引发加工费用，需单独核算加工成本，例如支付运输费时：
借：销售费用--运输费
贷：银行存款
当调拨行为具有销售实质时，需按正常销售处理。假设以含税价113万元调拨药品（税率13%），会计分录应包含：
借：应收账款 1,130,000
贷：主营业务收入 1,000,000
贷：应交税费--应交增值税（销项税额） 130,000
同时结转成本：
借：主营业务成本
贷：库存商品--药品
特殊情形下的税务处理需重点关注。若调拨药品属于免税项目（如特定医疗物资），需对进项税额做转出处理。例如调拨免税药品时，已抵扣的进项税应通过：
借：库存商品--药品（进项转出金额）
贷：应交税费--应交增值税（进项税额转出）
该处理可避免税务合规风险，符合《增值税暂行条例》对免税商品的规定要求。
