农业设施损毁的会计处理需根据资产性质进行分类，生物性在建工程与固定资产的核算存在显著差异。农业生产中，生物性在建工程指未达到预定可使用状态的林木、禽畜等生物资产，而固定资产则包含已投入使用的温室、灌溉系统等设施。两类资产因损毁原因不同（自然灾害或人为管理），会计处理路径呈现多样化特征，需结合《企业会计准则第5号——生物资产》和固定资产处理规范进行判断。
对于生物性在建工程毁损，需区分是否属于可继续营造状态。若因自然灾害导致部分损毁但项目仍可持续，应将净损失（扣除残值与保险赔偿）计入继续营造成本：借：生物性在建工程（其他支出）
贷：生物性在建工程
若损毁不可修复或非正常原因导致，则净损失需直接计入当期损益：借：营业外支出——非常损失
贷：生物性在建工程
固定资产毁损处理需通过清理科目过渡，具体流程包含：
- 转入清理：
借：固定资产清理（账面价值）
生物资产累计折旧（已提折旧）
贷：生产性生物资产（原值） - 记录清理费用：
借：固定资产清理
贷：银行存款 - 残值回收与保险赔偿：
借：原材料/其他应收款
贷：固定资产清理 - 最终净损失确认：
借：营业外支出——非常损失
贷：固定资产清理
特殊情形中，若损毁涉及存货类农业设施（如未成熟农产品），需通过待处理财产损溢科目过渡。例如鱼苗养殖池因管理不善毁损：
- 发现时：
借：待处理财产损溢
贷：消耗性生物资产 - 责任认定后：
借：管理费用（管理责任）
其他应收款（保险赔偿）
贷：待处理财产损溢
减值准备的计提需贯穿资产全生命周期。年度终了时，企业应对生产性生物资产进行可收回金额测试，若因长期损毁导致价值下跌：借：资产减值损失
贷：成熟生产性生物资产减值准备
该处理强调会计审慎性原则，避免资产价值虚高。实务中需注意税务差异，如自然灾害导致的非常损失可能享受所得税前扣除优惠，但需留存政府部门的灾害证明文件。
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