当小规模纳税人遭遇重复征税时，会计处理需兼顾税法的合规性与财务数据的准确性。重复征税可能源于系统操作失误、申报周期差异或政策理解偏差，具体场景包括同一税种多次扣缴、多缴税款未及时调整等。根据会计准则，此类问题需通过科目调整或税款抵扣实现账务平衡，核心涉及应交税费、其他应收款及损益类科目的联动处理。以下从实务角度分场景解析操作要点。
增值税重复缴纳是小规模纳税人最常见的情形。若企业因操作错误导致同一税款被多次扣缴，首次缴纳时应按常规分录处理：借：应交税费——应交增值税，贷：银行存款。重复扣缴部分需通过其他应收款科目挂账，后续处理可选择抵扣下期税款或申请退税。例如，某企业误缴增值税1,000元，需先记录为：借：其他应收款——多缴税款1,000，贷：银行存款1,000。下期申报时，将多缴部分抵减应纳税额：借：应交税费——应交增值税1,000，贷：其他应收款——多缴税款1,000。
附加税费重复计提的调整需结合增值税状态。附加税费以实际缴纳的增值税为计税基础，若增值税因重复缴纳被退回或抵减，则对应的附加税费需同步冲回。例如，企业误缴增值税1,000元并计提城建税70元（7%），发现错误后需先冲减附加税费：借：应交税费——应交城建税70，贷：税金及附加70。若附加税费已实际缴纳，还需通过其他应收款追溯多付款项。
所得税重复扣缴的纠正需区分预缴与汇算清缴场景。季度预缴时若发现前期多缴，应在当期计提中直接抵减：借：所得税费用（差额部分），贷：应交税费——应交所得税。例如，前期多缴所得税500元，当期应缴1,500元，实际分录为：借：所得税费用1,000，贷：应交税费——应交所得税1,000；同时冲销多缴款项：借：应交税费——应交所得税500，贷：其他应收款——多缴税款500。
实务操作中需注意三点：
- 科目衔接：重复征税涉及的往来科目（如其他应收款）必须与税费科目同步登记，避免账务脱节；
- 申报一致性：会计调整需与税务申报表数据匹配，例如增值税抵减需在电子税务局《增值税纳税申报表》第23栏“应纳税额减征额”填报；
- 政策时效：若多缴税款超过三年未处理，可能丧失退税权利，建议优先选择抵减后续税款。
正确处理重复征税问题，既能降低企业资金占用成本，也能规避税务稽查风险。财务人员应建立税款缴纳追踪台账，定期核对银行流水与申报记录，对异常扣款及时发起税务沟通流程。
