农民专业合作社在开展服务费业务时，其会计核算需兼顾《农民专业合作社会计制度》的特殊要求和一般企业会计准则的共性特征。这类业务既包含面向社员的内部服务，也涉及对外服务，其会计处理需准确区分经营收入与成员往来的关系，并正确处理增值税等税费计提。根据服务对象不同，其分录编制存在显著差异，需要结合资金流向和服务性质进行科目选择。
针对向成员收取服务费的情况，合作社需使用成员往来科目进行核算。例如为社员提供农资采购代理服务时，服务费属于合作社经营收入范畴，但因其与社员的经济往来属性，应通过往来科目过渡。具体分录为：借：成员往来—XX成员
贷：经营收入—服务费收入
该处理方式既体现服务交易的实质，又符合合作社与社员特殊经济关系的核算要求。若涉及增值税应税项目，需同步计提应交税费—应交增值税（销项税额）。
对于对外提供技术服务的业务，其会计处理更接近企业会计准则。当合作社向非成员单位提供技术咨询、设备维护等服务时，收入确认应采用一般销售模式：借：银行存款/应收账款
贷：经营收入—技术服务收入
若服务具有持续性特征，需要按照完工百分比法分期确认收入。服务过程中发生的直接成本应计入经营支出，如支付外聘专家费用时：借：经营支出—技术服务成本
贷：应付账款/库存现金
在支付第三方服务费的场景下，合作社需根据服务用途选择科目。为生产经营支付的设备维修费应计入经营支出，而管理类服务费则归入管理费用。例如委托会计师事务所审计的费用处理：借：管理费用—审计费
贷：银行存款
若取得增值税专用发票，可同步确认应交税费—应交增值税（进项税额）进行抵扣。
税费处理需特别注意增值税免税政策的适用。根据国家惠农政策，合作社向成员销售农资、提供技术服务等部分业务可享受免税优惠。此时服务收入全额计入经营收入，无需计提销项税。但若服务对象为非成员单位，需按6%税率计提增值税：借：银行存款
贷：经营收入
应交税费—应交增值税（销项税额）
期末结转时，所有与服务费相关的损益类科目需转入本年盈余。经营收入科目余额通过贷方结转，而经营支出、管理费用等则从借方转出。该结转过程体现合作社盈余形成机制，为后续的盈余分配奠定核算基础：借：经营收入
贷：本年盈余
借：本年盈余
贷：经营支出/管理费用
合作社在实务操作中，还需建立完善的成员账户体系，详细记录每位社员的交易量（额），这是执行"按交易量返还为主"分配原则的数据基础。同时要关注财政补助资金形成的资产量化要求，确保服务设施等资产的产权清晰。
