政府会计双分录通过同时运用收付实现制与权责发生制，在存货核算中实现预算管理与财务管理的有机衔接。这一模式下，每笔存货交易需编制两套分录：一套反映资金收支的预算会计记录，另一套体现资产变动的财务会计记录。这种设计既确保了财政拨款与支出的匹配性，又能完整呈现存货资产的价值流转，为政府会计主体提供多维度的管理信息支持。
在存货取得环节，双分录通过同步记录资金消耗与资产形成实现动态平衡。以行政单位外购存货为例：
借：存货（实际成本）
贷：资产基金——存货
同时针对资金支付：
借：经费支出
贷：零余额账户用款额度。若存在未付款项，则需增设待偿债净资产科目对冲应付账款。这种处理方式既通过经费支出科目反映预算执行进度，又通过资产基金科目维护净资产与存货的价值对应关系。
存货发出与耗用时，双分录聚焦于资产价值转移与预算消耗的匹配。业务部门领用材料时：
借：资产基金——存货
贷：存货。此分录不涉及资金流动，但通过冲减净资产中的资产基金科目，确保资产占用的资金规模与实际库存保持一致。同时，若存货用于自行加工，需通过加工物品科目归集直接材料、人工及间接费用，最终转入库存物品时再次运用双分录确认资产形态转换。
存货处置与清查异常的处理凸显双分录的纠偏功能。盘亏存货时：
借：待处理财产损溢
贷：存货
经批准核销后：
借：资产基金——存货
贷：待处理财产损溢。对于盘盈存货，则通过待处理财产损溢过渡后转入业务活动费用，实现账实差异的闭环处理。这一流程既遵循实物管理原则，又通过预算会计系统追踪异常损耗对财政资金的影响。
双分录模式的核心优势体现在三个方面：其一，通过资产基金与待偿债净资产科目构建资产与负债的镜像关系，确保每项存货变动均有对应的净资产变动；其二，以经费支出科目实时反映预算资金消耗，强化国库集中支付制度的执行监控；其三，通过待处理财产损溢等过渡科目实现跨期业务调整，兼顾会计分期假设与业务连续性需求。这种设计有效破解了传统单一核算体系下预算执行与资产管理脱节的难题，为政府综合财务报告编制提供坚实的数据基础。
