行政单位与企业会计存在显著差异，其月末结账需严格遵循政府会计制度的双重功能体系，既要处理财务会计科目，又要兼顾预算会计属性。根据现行制度规定，行政单位月末主要进行财务会计体系的收支结转，而预算会计在月末无需账务处理，但需完成账实核对等基础工作。这种设计体现了收付实现制与权责发生制的协同应用。
在财务会计领域，月末需完成本期盈余科目的构建。首先将当月取得的财政拨款收入、非同级财政拨款收入等收入类科目余额结转：借：财政拨款收入/非同级财政拨款收入/其他收入
贷：本期盈余
同时将业务活动费用、单位管理费用等费用类科目结转：
借：本期盈余
贷：业务活动费用/单位管理费用/其他费用
该结转完成后，本期盈余科目余额反映当月财务成果，但暂不进行二次分配。
预算会计月末处理主要集中于账务核对环节：
- 现金盘点需总账会计与出纳共同执行，编制库存现金盘点表
- 银行存款需编制余额调节表，确保账实相符
- 固定资产及存货实施抽盘，重点关注财政资金购置资产的完整性这些操作虽不产生会计分录，但属于月末结账的必要程序。
对于特殊事项需单独处理：
- 固定资产计提折旧时执行双分录：借：业务活动费用/单位管理费用
贷：固定资产累计折旧
借：累计盈余
贷：固定资产净值 - 财政直接支付资金到账时：借：行政支出（预算会计）
贷：财政拨款预算收入
同时财务会计作：
借：库存物品/固定资产
贷：财政拨款收入
年末结账与月末处理存在本质区别，需将本期盈余转入本年盈余分配，最终归集至累计盈余。而预算会计年末需完成财政拨款结转和非财政拨款结转的多级结转，涉及累计结转和累计结余等明细科目调整。这种分层结转机制确保了财政资金的专款专用属性。
实务操作中需特别注意：
- 专项资金收支必须与非专项资金分项核算
- 暂收暂付款项需及时清理，避免跨年度挂账
- 使用双基础核算系统时，需确保财务会计与预算会计数据勾稽
- 月末必须完成会计凭证连续性检查，确保凭证编号无断号、跳号现象
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