药店作为零售行业的重要分支，其会计处理需结合商品流通特性与增值税管理要求。根据经营主体的纳税人身份（一般纳税人或小规模纳税人），分录方式存在差异，核心环节包括采购、销售、费用核算及特殊业务处理。以下从业务场景出发，梳理典型会计分录逻辑与实操要点。
一、药品采购环节
库存商品和应交税费是采购分录的核心科目。一般纳税人采购时需区分价税：
借：库存商品（含税价仅限小规模纳税人）
借：应交税费—应交增值税（进项税额）
贷：银行存款/应付账款
若发生运费或装卸费，计入库存商品或销售费用科目。例如支付采购运费1000元：
借：库存商品/销售费用 1000
贷：银行存款 1000
二、药品销售及收入确认
销售收入需区分结算方式。以一般纳税人销售药品为例：
借：银行存款/应收账款/医保结算款
贷：主营业务收入
贷：应交税费—应交增值税（销项税额）（13%）
小规模纳税人若适用免税政策，可不计提应交增值税。销售完成后需结转成本：
借：主营业务成本
贷：库存商品
三、费用类业务处理
- 租金水电费支付：
借：销售费用/管理费用
贷：银行存款 - 工资社保计提与发放分两步操作：
- 计提：借：销售费用 贷：应付职工薪酬
- 发放：借：应付职工薪酬 贷：银行存款/其他应付款
四、特殊业务处理
- 库存盘盈盘亏：
- 盘盈：借：库存商品 贷：待处理财产损溢
- 盘亏：借：待处理财产损溢 贷：库存商品
查明原因后转入管理费用或营业外收支
- 促销活动赠品视同销售：
借：销售费用
贷：库存商品
贷：应交税费—应交增值税（销项税额）
五、涉税处理要点
- 增值税税率差异：
- 西药/中成药适用13%，部分中药饮片可能适用9%
- 小规模纳税人3%征收率（2023年阶段性减按1%）
- 企业所得税注意事项：
- 过期药品损失需留存证据
- 广告费扣除限额为收入15%
- 个税代扣：工资按累进税率，分红按20%缴纳
通过以上分类处理，可实现药店经营全流程的财务管控。需特别关注医保结算款的权责发生制确认，以及进项税额转出等特殊税务操作。建议定期核对账实差异，结合财务软件提升核算效率。
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