农民专业合作社的账务处理既遵循复式记账法基本原则，又因农业生产周期长、生物资产特殊等特点形成独特核算体系。其核心在于通过生产成本归集、生物资产转化、经营收支结转三大环节，完整反映从生产资料投入到最终盈余分配的全流程。以下从成本核算、收入确认、费用结转三个维度展开具体分录操作要点。
在生产成本归集环节，合作社需区分直接成本与间接成本。采购化肥农药时通过原材料科目暂存，使用时转入生产成本科目。例如采购有机肥支出5000元：借：原材料——有机肥 5000
贷：银行存款 5000
实际施肥时：借：生产成本——直接材料 5000
贷：原材料——有机肥 5000
对于固定资产折旧这类间接成本，需按月计提：借：生产成本——折旧费
贷：累计折旧
生物资产核算呈现动态转化特征。购入种畜时直接计入幼畜及育肥畜科目，成龄后需转为生产性生物资产。例如购入价值2万元的仔猪：借：幼畜及育肥畜 20000
贷：银行存款 20000
饲养期间发生的饲料费、人工费通过农业生产成本归集后结转：借：幼畜及育肥畜
贷：农业生产成本
当仔猪成长为种猪时：借：生产性生物资产
贷：幼畜及育肥畜
经营收支结转体现合作社双重属性。销售自产农产品时需同步结转成本，例如销售玉米收入10万元：借：银行存款 100000
贷：经营收入 100000
同时：借：经营支出
贷：产品物资
年末结转损益时，需将经营收入、其他收入等科目余额转入本年盈余贷方，而经营支出、管理费用等转入借方，最终形成年度经营成果。
特殊业务处理需特别注意三点：
- 成员往来服务费需通过成员往来科目核算
- 自然灾害损失经批准后计入营业外支出
- 政府补助等非经营性收入计入其他收入例如收到成员缴纳的加工服务费：借：成员往来
贷：经营收入
这些核算规则既保持了与《农民专业合作社财务会计制度》的衔接，又通过生物资产、成员往来等特色科目设置，精准匹配农业生产从育苗育种到产品销售的完整价值链。会计人员在实务中需特别注意生物资产状态转化时的科目衔接，以及成员经济往来与非成员交易的核算差异。
