企业支付厂房款项的会计处理需要根据厂房建设阶段和款项性质进行区分。新建厂房通常分为建设期和完工期，不同阶段的资金流动需匹配对应的科目核算，确保资产价值和费用归属的准确性。以下将从预付工程款、直接支付工程款、物资购置及结转固定资产四个环节展开具体说明。
在预付厂房工程款时，企业需通过在建工程科目进行核算。例如，向建设单位预付30万元工程款时，会计分录为：借：预付账款—XX建设单位 300,000；贷：银行存款 300,000。待实际发生工程支出并取得结算凭证后，需将预付账款转入在建工程科目，即借：在建工程—厂房工程 300,000；贷：预付账款—XX建设单位 300,000。此过程需注意合同履约进度的确认，避免提前或滞后确认成本。
若企业直接支付当期工程款项且无需预付，会计分录应直接计入在建工程科目。例如支付50万元工程款时，记账方式为：借：在建工程—厂房工程 500,000；贷：银行存款 500,000。若涉及工程物资采购（如钢材、水泥），需先通过工程物资科目归集，领用时再结转至在建工程，具体流程为：采购时借：工程物资 200,000；贷：银行存款 200,000；领用时借：在建工程—厂房工程 200,000；贷：工程物资 200,000。
厂房完工验收后，需将在建工程全额转入固定资产。假设累计发生工程支出1,000万元，结转分录为：借：固定资产—厂房 10,000,000；贷：在建工程—厂房工程 10,000,000。此时需同步启动折旧计提，通常采用直线法，例如按20年使用年限、5%残值率计算，月折旧额为39,583元（10,000,000×95%÷240），分录为：借：制造费用/管理费用 39,583；贷：累计折旧 39,583。
实务操作中需重点关注三个要点：一是资本化时点的判定，需以工程达到预定可使用状态为标准；二是工程物资管理，须建立严格的出入库台账；三是税务处理，增值税专用发票的进项税额可按规定抵扣，但用于非应税项目的工程物资需作进项税转出。此外，若工程款包含质量保证金，建议通过应付账款—质保金科目单独核算，待质保期结束后再行支付。
