医疗保险作为企业为员工提供的重要福利保障，其会计处理需要严格遵循权责发生制和费用配比原则。根据我国现行会计准则，医保费用的核算需区分单位承担部分和个人承担部分，并通过应付职工薪酬科目实现全过程跟踪。正确处理这类业务不仅能准确反映企业的人工成本结构，还能为税务申报和社保审计提供清晰的财务依据。
在计提阶段，企业应按照工资总额的核定比例确认单位负担的医保费用。此时会计分录为：
借：管理费用——社会保险费（单位部分）
贷：应付职工薪酬——社会保险费（单位部分）
若涉及生产部门人员，借方科目可调整为制造费用；销售部门人员则使用销售费用科目。这种科目设置体现了费用归属原则，确保成本核算的准确性。
处理工资代扣环节时，需通过双重分录实现资金流转的记录：
- 应发工资总额核算：
借：应付职工薪酬——工资（应发数）
贷：其他应付款——社会保险费（个人部分） - 实发工资支付：
借：应付职工薪酬——工资（实发数）
贷：银行存款
这一流程既完整记录了企业代扣义务，又清晰反映员工实际所得，为后续的个税申报奠定基础。
实际缴纳阶段的会计处理需要同步反映单位和个人缴费情况：
借：应付职工薪酬——社会保险费（单位部分）
借：其他应付款——社会保险费（个人部分）
贷：银行存款
该分录实现了资金流与业务流的匹配，通过应付职工薪酬科目的借方结转，完整核销前期计提的负债。
特殊情形处理需特别注意：
- 员工工伤医疗费用报销应通过其他应收款科目过渡，待社保机构赔付后冲减
- 跨期费用需按权责发生制进行预提或递延处理
- 医保退费应红字冲销原分录，避免虚增费用
日常管理中建议建立医保台账，按月核对缴费基数、比例和金额，定期与社保部门对账。通过设置辅助核算项目，可细化部门、人员类别的费用分析，为优化人力成本提供数据支持。
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